Biobanking- und Laborleistungen, die von den Biobanken und Partnern von BBMRI.at angeboten werden
Die Biobanken von BBMRI.at haben das Ziel, Forscherinnen und Forscher zu unterstützen, die mit biologischem Material und zugehörigen Daten arbeiten oder beabsichtigen, dies zu tun. Sie möchten das Leben der Forscher erleichtern und sie mit ihrer Biobanking-Expertise in verschiedenen Schritten des Biobanking-Workflows unterstützen.
Biobanken bieten Zugang zu Proben und zugehörigen Daten und/oder vermitteln Forscher an Hauptermittler von Proben-/Datenkohorten für potenzielle Zusammenarbeiten in der Industrie oder in von der EU geförderten Projekten.
Die Partnerbiobanken von BBMRI.at bieten auch verschiedene Dienstleistungen an und arbeiten gut mit verschiedenen Partnern zusammen, um ihr Serviceportfolio zu erweitern.
Services der Biobank-Partner von BBMRI.at
Bereitstellung von Zugang zu Proben und Daten
- Tierische Proben und Daten (Katze, Hund, Frettchen, Meerschweinchen, Hamster, Pferd, Affe, Maus, Schwein, Ratte, Schaf)
- Menschliche Proben und Daten
- Paraffinblöcke (FFPE)
- Paraffinschnitte (auf Objektträger montiert, ungefärbt)
- Flüssigproben (Serum, EDTA-Plasma, Li-Hep-Plasma, Na-Citrat-Plasma, Buffy Coat, Urin, Vollblut, Speichel, Follikelflüssigkeit, Seminalplasma, Synoviaflüssigkeit, Liquor, Stuhl, Aszites, PBMCs)
- Frisches gefrorenes Gewebe
- Gefrorene Gewebeschnitte (z. B. auf Objektträger montiert oder in Röhrchen für die Nukleinsäureanalyse)
- Histologische Schnitte (z. B. H&E, CAB, …)
- Immunhistologische Schnitte
- Ganze Schnittbilder (d. h. digitale Bilder von (Immuno)histochemischen Schnitten)
- Gewebe-Mikroarray-Paraffinblöcke
- Gewebe-Mikroarray-Paraffinschnitte
- Primärzellen und Zellkultur
- Andere Probentypen (z. B. isolierte RNA, DNA, Protein, …)
Probenbearbeitung
Verarbeitung der oben genannten Probentypen.
Kapazitäten für die Probenlagerung
- 24/7 temperaturüberwachte Lagerung von Proben unter verschiedenen Bedingungen
- Langzeitlagerung von archivierten Proben
- Ultra-Tiefkühltruhe (-70°C bis -90°C) 24/7
- kontrolliert Dampfphasenflüssiger Stickstoff (-135°C bis -196°C) 24/7 kontrolliert
Unterstützung von Forschungsprojekten
- Unterstützung von Forscher*innen während des Prozesses des Probenzugriffs
- Unterstützung von Forscher*innen bei der Einreichung von Ethikanträgen für ein bestimmtes Projekt
- Prospektive Probensammlung (Planung)
- Prospektive Probensammlung/Verarbeitung/Lagerung/Probenmanagement (Durchführung)
- Aufbau von prospektiven Probenkollektionen nach ISO/CEN/TS-Standards (z. B. ISO 20166; ISO 20184, ISO 20186, etc.)
- Unterstützung von Forscher*innen hinsichtlich aktueller Anforderungen an (präanalytische) Qualitätsstandards
- Pathologische Bewertung und Auswahl geeigneter Fälle
- Organisation von Proben-/Datenübertragungen
Zugehörige Infrastruktur und Ausstattung
- Gemeinsame Nutzung von Biobank-Equipment/Laborflächen
- BSL2-Labor
- BSL3-Labor
- Verschiedene (lokale) Partner mit spezialisiertem Equipment, Fachkenntnissen und Serviceangeboten (z. B. Core Facilities)
Beratung zu Themen im Zusammenhang mit Biobanking
- Labormedizin (Auswahl geeigneter Antikoagulanzien, Lagerbedingungen, etc.)
- Studiendesign
- Qualitätsmanagement und Qualitätskontrolle
- ISO-Standards (und CEN/TS) im Biobanking
- Umsetzung von Standards und SOPs in Biobanking-Prozessen
- Datenmanagement
- Ethikfragen und rechtliche Fragen
- Projektmanagement
- Statistik
- Budgetierung und Geschäftsplanung
Dienstleitungen für Spender*innen
- Bearbeitung von Rücknahmen von Einverständniserklärungen
- Biobank Führungen vor Ort für die Öffentlichkeit
Datenmanagement
- Entwicklung einer Datenbank für Forschungskohorten
- Praxishilfe zur Anonymisierung & Pseudonymisierung
Services in Verbindung mit Infektionskrankheiten
- Isolierung von Viren, RNA, DNA, Proteinen
- Gesamtgenomsequenzierung
- Neutralisationstests usw.
Services in Verbindung mit Krebsforschung
- Gesamtexomsequenzierung
- Gesamtgenomsequenzierung
- Digitale Pathologie – Massenscannen für Ganzschnittbilder
- Metabolomics
- Lipidomics
- Isolierung/Aufbau von patientenabgeleiteten Zelllinien (kurz- und langfristige Kulturen)
- Isolierung/Aufbau von krebsassoziierten Fibroblasten vom gleichen Patienten
- Zellkultur-3D-Modelle
Weitere Services
- Kontakt und Vernetzung mit anderen Biobanken
- Ausbildungs- und Schulungskurse für Biobanking
- Biobank-Führungen vor Ort für Experten (z. B. Forscher, Ärzte, Kooperationspartner usw.)
