{"id":13168,"date":"2024-09-11T07:43:25","date_gmt":"2024-09-11T05:43:25","guid":{"rendered":"https:\/\/bbmri.at\/?post_type=news-articles&p=13168"},"modified":"2024-10-16T09:55:49","modified_gmt":"2024-10-16T07:55:49","slug":"collectionlocator-zugang-zu-biobank-daten-fuer-fortgeschrittene-medizinische-forschung","status":"publish","type":"news-articles","link":"https:\/\/bbmri.at\/de\/news-articles\/collectionlocator-zugang-zu-biobank-daten-fuer-fortgeschrittene-medizinische-forschung\/","title":{"rendered":"CollectionLocator: Zugang zu Biobank-Daten f\u00fcr fortgeschrittene medizinische Forschung"},"content":{"rendered":"
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\n BBMRI.at Publikation <\/h3>\n \n

\n CollectionLocator: Zugang zu Biobank-Daten f\u00fcr fortgeschrittene medizinische Forschung <\/h1>\n \n

\n Forscher*innen des BBMRI.at-Partners haben ein innovatives Tool namens CollectionLocator entwickelt, um die FAIR-Konformit\u00e4t von Biobank-Daten zu verbessern und ihre Nutzung f\u00fcr Forschung und medizinische Studien zu erleichtern. Dieses Tool soll Forschern dabei helfen, die geeignetste Biobank und Sammlung zu finden, die die f\u00fcr ein bestimmtes Forschungsprojekt ben\u00f6tigten biologischen Proben und die zugeh\u00f6rigen Daten enthalten kann, selbst wenn detaillierte Probendaten aufgrund von Datenschutzbedenken eingeschr\u00e4nkt sind.
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Biobanken sind wesentliche Ressourcen f\u00fcr die medizinische Forschung, da sie biologisches Material und damit verbundene Daten sammeln und f\u00fcr Forschungsprojekte und medizinische Studien zur Verf\u00fcgung stellen. Ein h\u00e4ufiges Problem bei der Forschung mit Biobank -Daten ist die Schwierigkeit, relevante Sammlungen zu finden, die den Anforderungen eines Forschungsprojekts entsprechen. Eine k\u00fcrzlich durchgef\u00fchrte Umfrage ergab, dass 60 % der Forscher den Umfang ihrer Forschung einschr\u00e4nken mussten, weil sie Schwierigkeiten hatten, relevante Daten aus Biobanken zu erhalten.<\/p>\n

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Dar\u00fcber hinaus m\u00fcssen Biobank-Daten bestimmte Kriterien erf\u00fcllen, die sich als \u00dcbereinstimmung mit den FAIR-Prinzipien<\/em> (Findable, Accessible, Interoperable and Reusable\/ bzw. Auffindbar, Zug\u00e4nglich, Interoperabel und Wiederverwendbar) formulieren lassen. Genau hier erweist sich der CollectionLocator<\/em> als hilfreich.<\/p>\n

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Der CollectionLocator<\/em>, der als Prototyp von Forscher*innen der BBMRI.at-Partner Alpen-Adria-Universit\u00e4t Klagenfurt und Medizinische Universit\u00e4t Innsbruck entwickelt wurde, basiert auf einem ontologiebasierten Metadatenmodell, um der enormen Heterogenit\u00e4t der Biobank-Daten Rechnung zu tragen und sowohl die Privatsph\u00e4re der Spender*innen als auch die Datenqualit\u00e4t zu gew\u00e4hrleisten. \u00dcber eine benutzerfreundliche Suchoberfl\u00e4che k\u00f6nnen Forscher*innen nach Sammlungen suchen, die ihre Kriterien hinsichtlich Inhalt und Qualit\u00e4t der Daten erf\u00fcllen.<\/p>\n

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Au\u00dferdem stellt der CollectionLocator<\/em> die Daten- und Metadatenqualit\u00e4t der Datensammlungen dar, sodass die Qualit\u00e4tsanforderungen der anfragenden Person mit den Qualit\u00e4tsanforderungen der verf\u00fcgbaren Daten abgeglichen werden k\u00f6nnen. Eine Proof-of-Concept-Implementierung demonstriert die Effektivit\u00e4t des Tools bei der \u00dcberwindung bestehender Ineffizienzen.<\/p>\n

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Das Tool zielt darauf ab, die Reproduzierbarkeit von Forschungsergebnissen zu unterst\u00fctzen und den Zugriff auf qualitativ hochwertige Daten zu erleichtern, indem Metadaten aus verschiedenen Biobanken in eine zentrale Sammlung integriert werden. Der CollectionLocator<\/em> tr\u00e4gt somit zu einer verbesserten Nachvollziehbarkeit und Wiederverwendbarkeit von Biobank-Daten bei, insbesondere in F\u00e4llen, in denen die vollst\u00e4ndigen Daten aufgrund von Datenschutzbestimmungen nicht direkt zug\u00e4nglich sind. So maximiert er die Nutzung vorhandener Datenressourcen bei gleichzeitiger Gew\u00e4hrleistung der FAIR<\/em>-Konformit\u00e4t und des Datenschutzes.<\/p>\n

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Shekhovtsov, V.A.; Slajcho, B.; Sacherer, A.; Eder, J. CollectionLocator Level 1: Metadata-Based Search for Collections in Federated Biobanks CORNELL UNIVERSITY, 2024. doi: 10.48550\/arXiv.2408.16422<\/em><\/p>\n <\/div>\n \n <\/div>\n\n\n\n

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